De San José a Quepos hay una distancia de 174 kilómetros y los autobuses directos salen de la terminal de buses de la Coca Cola, en San José. En el transporte terrestre existen dos tipos de servicios: el servicio directo en buses confortables y grandes que sale diariamente tres veces al día, y que demora tres hora y media de viaje y cuyo costo del pasaje es de US $ 5.00. El otro servicio cuenta con cinco salidas al día, demora un tiempo de 5 horas y tiene un costo de US $ 4.00.
Por ser Manuel Antonio uno de los destinos turísticos más populares del país, los fines de semana, y durante la temporada alta, se requiere comprar el billete de autobús por lo menos con tres días de anticipación. El servicio de buses entre Quepos, estación Central y el Parque Nacional Manuel Antonio sale cada media hora desde las 5:00 a.m. hasta las 10:00 p.m. y cuesta unos US $0.40.
Si quiere rentar un carro es recomendable que sea un 4x4 porque hay ciertos tramos del camino que son difíciles. Desde Alajuela se va al Oeste por la vía Costanera Sur y se pasa por los pueblos de Atenas, Orotina, Tárcoles, Jacó, Parrita, Quepos y finalmente Manuel Antonio. Pero si desea comodidad y prontitud, por vía aérea existen dos compañías que realizan hasta seis vuelos regulares diarios en temporada alta. El costo es de US $ 40 y el vuelo tarda 20 minutos. Ambos servicios cuentan con transporte privado en mini buses hacia el hotel de su preferencia.